现任上海中医药大学附属曙光医院肛肠科主任医师、教授，曙光临床医学院肛肠病教研室和研究室主任，兼任国家卫生部新药审评专业委员会主任委员、国家中医药管理局科技进步奖审评委员会委员，国家自然科学基金审评委员会委员，全国肛肠学会副会长，全国痔病专题组组长，全国高等医学教育学会肛肠分会副主任委员，上海市高级职称评审委员会委员、上海市药审委员会委员、上海市中医药学会常务理事、上海市肛肠学会主任委员，上海市中医肛肠病医疗协作中心主任，上海市名老中医专家学术经验继承人导师、《中国肛肠病杂志》编委会副主任委员、《上海中医药杂志》编委。１９９７年被命名为上海市名中医。 　

　　现任第二军医大学附属东方肝胆外科医院院长、中国人民解放军肝胆外科研究所所长、解放军科学技术委员会副主任。中国科学院院士。党的“十四大”代表，第七、八、九、十、十一届上海市人大代表。

专业技术水平

　　肝癌的早期诊断及中晚期肝癌的手术治疗及综合治疗，半个世纪以来，吴孟超教授在肝胆外科领域辛勤耕耘，顽强拼搏，特别是对肝脏疾病治疗和研究进行了开创性工作。

　　首次提出中国人肝脏临床分为五叶四段的新理论；

　　首创常温下间歇肝门阻断切肝法并突破手术禁区首先开展中肝叶切除手术；

　　最早提出肝脏代谢理论的研究，首先提出局部切除新观点，使死亡率从70年代的14.5%下降到0.35%；

　　确立肝癌高危人群准确定义，提出早期诊断合理程序并提出甲胎蛋白异质体鉴别诊断肝癌，使早期诊断符合率达98%；

　　建立无血切肝术，在国内较早开展肝动脉结扎法和栓塞法治疗中晚期肝癌；

　　提出肝癌术后复发再切除和肝癌二期手术新观点，提高了疗效。

　　近年在肝癌的免疫和基因治疗、肝癌疫苗、肝脏移植等研究中取得较大进展和提出综合治疗新观点，可采用与手术同时进行的介人、间质、免疫、导向、生物、基因、和中医中药等措施，为肝癌综合治疗开创新局面。

　　临床擅长：肝癌的早期诊断及中晚期肝癌的手术治疗及综合治疗，达到国际先进水平。是我国肝外科的开拓者和主要创始人之一，国际著　　名肝癌专家，1993年获美国旧金山东华医院荣誉奖、陈嘉庚医学科学奖、1997年获全军医疗特殊贡献奖、1998年获全国百名名医奖。

　　先后获国家、军队和上海市科技进步一等奖、二等奖共24项，发表论文200余篇（其中《Science》1篇），编写或参与编写专著20部。